Une prépublication qui cartographie la diversité antigénique de SARS-CoV-2 sur la base des données de neutralisation par anticorps.
Les 4 premiers variants préoccupants étaient relativement proches des lignages du printemps 2020, ce n'est pas le cas de omicron.
*Pour les virus de la grippe, les variants sont considérés antigéniquement similaires dans le cas d'une distance antigénique inférieure à 3 unités antigéniques, c'est-à-dire un changement d'un facteur 8 dans les titres de neutralisation, et différents au-dessus de ce seuil.
Par analogie, le [virus] ancestral, et les variants [B.1.1.7, B.1.351, P.1] et Delta appartiennent à un seul amas antigénique. Néanmoins, la distance entre cet amas antigénique et Omicron est de plus de 5 unités antigéniques (> un facteur 32 dans la neutralisation)ce qui est implique qu'Omicron représente un premier nouveau variant majeur circulant largement."
"Nous pouvons tirer plusieurs conclusions. Premièrement, la neutralisation homologue était généralement plus fort que la neutralisation hétérologue."
"Nos données suggèrent que des vaccins mis à jour sur la base des variants B.1.351 ou Delta n'auraient pas été sensiblement plus efficaces que ceux basés sur le virus ancestral."
"La longue distance antigénique entre Omicron et les variants précédents dans la carte antigénique indique que les niveaux élevés d'infections actuels par Omicron sont au moins partiellement associés à de l'échappement immunitaire et qu'une mise à jour du vaccin est requise."
Même si on parvenait à atteindre temporairement une immunité collective pour omicron, on n'aurait la paix que jusqu'à l'arrivée de la prochaine souche antigéniquement distante. Il suffit de regarder de ce qui s'est passé en Inde : après un bon milliard d'infections entre l'été 2020 et l'été 2021, ils approchaient sans doute de l'immunité collective face à Delta (courbe déclinant lentement depuis fin juin 2021).
Ensuite, omicron est arrivé et l'épidemie depart avec une croissance exponentielle depuis début janvier:
https://nitter.fdn.fr/pic/media%2FFIVY_mAXoAAKMh_.jpg
voila le lien vers le preprint.
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.01.03.21268582v1