Oui, la science est une institution, bien sûr. Pas au sens restreint d'association aux statuts déposés, mais au sens d'ensemble de procédures, de normes, de règles, de pratiques, d'attributions... qui sont instituées (on les décide, elles n'apparaissent pas ex nihilo), et instituées par des humains. C'est bien l'apport de la sociologie des sciences que de dessiner tous ces contours justement.
Et la science n'est pas une méthode, ou alors... une méthode instituée ! Sinon il y aurait pas des trillions d'articles d'épistémologie qui débattent de "la" méthode scientifique. Par ailleurs, cette méthode, pour être validée, doit l'être par la relecture des pairs, c'est à dire par quelque chose qui commence de plus en plus à ressembler à une institution en bonne et due forme :)
Après s'il faut jouer sur les mots, on peut conserver une "idée de science" qui serait un idéal hors institution (mais ça commence drôlement à ressembler à de la religion ce bordel) ; et se contenter de dire que la science, en tant que réalisation concrète dans le monde empirique est une institution (puisqu'elle passe par des organisations, des procédures, des outillages, etc.).
Enfin, il est totalement de faux de dire que la science qui s'appuie sur une idéologie n'est pas de la science ; à moins d'assumer que l'on n'a jamais vu de science. Rien n'échappe à certaines pré-conceptions, évidences, modes du moment, air du temps culturel, etc. L'idée même de science (ou du moins ses attributions, ses modalités, et ses objectifs) peut être considérée comme une idéologie !
Je suis toujours gêné quand je dis ce genre de truc car ça ressemble à du vulgaire post-modernisme "tout est construction sociale, donc tout se vaut, donc rien ne vaut blah blah". Or non, ce n'est pas parce que tout est construit que tout se vaut, et reconnaître que certaines choses sont mieux construites que d'autres pour certaines applications est possible. Inutile de se battre Dieu contre Dieu, ta religion contre ma science divinisée. On peut reconnaître que la science est une institution, tout en pouvant affirmer en toute rationnalité que cette institution est digne de confiance quand il s'agit, par exemple, de décider si oui ou non le changement climatique est d'origine anthropique !
Je ne suis pas sûr que conserver un fantasme de Science exempte de toute l'irrationalité que l'on attribue à la politique ou à la religion ou à l'art soit finalement une bonne façon de défendre cette institution qui, malgré ses faiblesses, est quand vachement plus cool que beaucoup d'autres.
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